豬流產胎兒中豬圓環病毒3型的檢測及其遺傳演化分析

【摘要】：為分析豬流產胎兒中豬圓環病毒3型（porcine circovirus type 3，PCV3）的感染及其遺傳進化情況。對2015—2017年采集的湖南省680份豬流產胎兒病料樣品進行PCV3檢測、擴增和測序，并利用生物信息學軟件對獲得的序列進行遺傳進化分析。結果顯示，豬流產胎兒樣品中PCV3陽性率為24.4%（166/680），其中2015—2017年陽性率分別為18.2%（26/143）、22.7%（54/238）和28.8%（86/299）。從PCV3陽性樣本中獲得了1株PCV3基因組全長序列，命名為PCV3/CN/Hunan-57（GenBank序列登錄號為MZ934695），與國內外毒株基因組序列相比，相似性為97.8%～99.2%；獲得了5株PCV3 ORF2基因序列，它們的核苷酸和氨基酸相似性為97.5%～98.3%和96.7%～99.7%，與國內外參考毒株ORF2基因序列相比，其核苷酸和氨基酸相似性為96.3%～99.2%和96.8%～100%?；贠RF2基因序列構建遺傳進化樹和進行多重序列比對，發現獲得的PCV3陽性序列分別屬于PCV3a（1株）和PCV3c（4株），并鑒定出T100A、G113S和A184S突變位點。研究表明豬流產胎兒中PCV3感染率較高，且存在不同類型的PCV3毒株感染，為后續深入研究PCV3遺傳變異及其相關致病性提供了重要參考信息。